基因检测携手互联网 推动精准医学再进步

[2017/12/25]

    2017年12月22日,云健康基因科技(上海)有限公司(以下简称:云健康)总裁/CEO金刚博士与阿里云上海分公司(以下简称:阿里云)总经理张婷华,在上海正式签署了基因组大数据云计算战略合作协议,双方未来将加快BT(生物技术 )和IT(信息技术)的深度结合,利用云端优化基因大数据的存储、分析、管理等,挖掘和转化云健康已拥有的万人基因组数据。并将借助阿里云存储和计算能力,加快云健康承担的发改委10万人群基因检测惠民工程的数据建设工作,进一步深入揭示中国人群遗传突变分布,推动中国精准医学和大健康产业的发展。
 
  目前,基于阿里云的公共云平台和强大的技术实力, 已完成了云健康的云平台搭建, 部署和实施了数据生产系统CHAPM、云健康基因云分析平台CHGCloud(该平台目前已经部署了全基因组、外显子、转录组、甲基化、三代测序组装等数十个分析流程)、数据分析研发平台, 并实现了云健康上海总部和南京分公司的10G专线和云端高速互联互通。
 
  云健康作为发改委首批基因检测示范中心,建立了超高通量全基因组测序技术平台NovaSeq 6000、HiSeq X Ten、PacBio Sequel,承担着国家十三五精准医学大数据标准体系建设、华东人群大队列、基因大数据等国家级和上海市重大项目,这将会产生百万级人群的基因大数据及健康医疗信息,这些PB级,甚至ZB级数据的挖掘和应用面临前所未有的挑战。通过与阿里云的专线直连, 结合云健康自建的本地计算和存储中心, 极大地增强了云健康的存储和数据分析通量及弹性。此外, 阿里云在全国部署的众多数据中心为云健康的数据交付业务提升了一个量级。通过本地数据实时上云和自动化数据生产业务的部署,云健康将再次为客户项目缩短检测和数据交付周期。
 
  此次合作将大力提升云健康大数据的存储和计算能力,充分发挥多生产中心的优势,可满足海量数据的吞吐和计算;拥有专线直通上海超算中心和阿里云,已部署完成的云健康基因云分析平台CHGCloud可对基因组数据实现实时云端上传、数据质量控制和自动化数据生产,可更加快捷、智能地对海量基因组数据进行传输和生物信息自动化分析,此外依托阿里巴巴多年安全技术研究积累成果,提供多场景、全方位数据安全防护。
 
  双方作为国家级高新技术企业,此次合作,双方将建立大健康产业标杆合作,有利于双方在国家大数据战略和精准医学计划中赢得首发优势。云健康将发挥全国测序通量保持前列及生物信息大数据人才队伍一流的优势,大力发展人群基因检测服务和建设中国人群基因组大数据。阿里云将利用其积攒的云计算、人工智能等先进技术通过云健康的合作共同参与国家医疗健康大数据战略研究。